大古是一个憧憬着电视节目《奥特曼》中的奥特曼形象，梦想是有朝一日能成为宇宙船船长的平凡少年。　　现在还在逐渐成长中，目前只是横浜市观光课的一名普通公务员。　　没错，本作的舞台是和之前的昭和·平成系列毫无联系，　　平行存在于现实世界中的横浜。　　幼年时憧憬着成为职业棒球选手的飞鸟，现在是横浜体育场的一名球童。　　阿良也作为飞鸟的同事而不断支持着他。　　把“开发出大古梦想所能够驾驶的飞船”作为理想目标的我梦，　　目前和敦子一同作为横浜MaliTime博物馆的实习生而奋斗着。　　就在同时，为追赶超越了时间和空间的格斯拉王，梦比优斯奥特曼出现在了横浜港。　　他是唯一一个知道降临在我们世界的这一切的引导性角色。　　「让７名勇者再次觉醒、并一同去打倒侵略者」　　出现在梦比优斯面前说着这么番话的穿着红鞋的少女究竟是？　　随着格斯拉王的出现、在山下码头也同样出现了庞敦王。　　那是曾一度打败赛文奥特曼的强敌。　　和在横浜体育场工作的飞鸟，在横浜MaliTime博物馆工作的我梦，　　以及大古这３人相聚在一起谈论年幼时的梦想和将来的打算，　　期待着未来和他们擦出的火花吧。　　早田、团、乡、北斗这４人也同样只是普通的人类。　　并且也分别和秋子、安奴、秋、夕子结了婚，拥有了各自幸福的家庭。　　《迪迦奥特曼》第２６话《彩虹的怪兽魔境》中登场的刚力怪兽希尔巴贡，　　第３６话《超越时空的微笑》中登场的超力怪兽哥尔德拉斯，　　都以希尔巴贡王和哥尔德拉斯王的身份复活了。　　两只都是与时间和空间有关的怪兽，出现在这个世界也合情合意。　　在与未来的谈话中，大古更加确信了自己的目标。　　但是当从未来口中得知「穿着红鞋的少女」时，大古曾一度淡忘的记忆再次苏醒。　　还是孩子的他，当时也曾见过穿着红鞋的少女。　　将怪兽召唤至这个世界的幕后元凶，地狱星人超级希伯利特星人出现了。　　当他把梦比优斯变成青铜像后准备大肆破坏之时，　　从未见过的奥特曼出现了，　　他的名字是「迪迦」！　　昭和宇宙人和平成奥特曼激突！

在空地上，小夫（肝付兼太 配音）向大家炫耀现在最畅销的神秘火车的车票，胖虎（立壁和也 配音）和静香（野村道子 配音）恳求小夫也带他们去。这时，大雄（小原乃梨子 配音）急匆匆跑了过来，哆啦A梦（大山信代 配音）已经三天没回家，小夫和胖虎在一旁幸灾乐祸的笑着。晚上，哆啦A梦回来了，原来这三天他跑到了22世纪去买银河列车的车票。第二天晚上，银河列车在后山停站了，大雄和哆啦A梦开始了他们的银河之旅，车长（伊仓一恵 配音）总是笑嘻嘻，很有礼貌。另一边，神秘的生命体降落在了后山，是来自宇宙的寄居物，寄居物将自己附在人类的身体上，来操纵人的大脑，他们的目的是将整个地球毁灭掉。　　在车上奇奇怪怪的事情发生不断，大雄在车厢外看到了一个忍者，小夫说看见了海盗，胖虎则看见了恐龙。哆啦A梦告诉大雄他们出现了一伙“神秘黑色影团”。遭到黑色影团的袭击后，列车在一颗行星上停下了，而冒险这才刚刚开始……

世界观　　故事发生在时间和地点皆无法判明的超未来。　　世界由高度发达的网络（软件）和作为其现实载体的超构造体（硬件）所构成。本该是得益于科技繁荣发展的人类却由于一场灾难丧失了连接网络的资格和能力（相当于公民权）。　　没有了支配者的AI依据管理规定开始排斥失去了网络连接资格的人类。而忘却了曾经的繁荣的人们，只能在管理系统的阴影下苟且偷生。本作的舞台就被设定在这样一个人类日渐衰亡的世界。　　都市构造体　　作为舞台的世界就像一个巨大的高楼或者说是连接了所有建筑的巨大都市。大部分为超构造体所遮蔽，形成了阶梯结构。由于建设者的失控，都市构造体正在无止境地扩大之中，就本作故事发生的时间为止至少已抵达木星轨道面。根据统治局描述，正是都市的这样漫无目的地成长从根本上导致了波及全世界的混乱。其结果毋庸置疑的人口密度极度下降。　　环境　　就都市构造体所涉及的范畴由于其间散布的纳米机器人的作用保证了生物学上的病毒的排除实现了无菌状态。而这一成果则是由曾经机能正常运转时候的网络球给予统治局的指示所实现的。同一作者的《BIOMEGA》和《DEADHEADS》作品主体中的由于强力病毒引发的传染病在本作中原则上是不可能发生的。从这些设定中可以推断作为网络終端遗传因子的变异原因的“感染”不等同于其字面上的感染，很有可能是由于系统逻辑上的分歧所引起的。　　故事大纲　　探索者雾亥流浪在数千层无边无际的巨大阶梯都市之中。手持可以贯穿一切物质的重力子放射线射出装置追寻着网络終端遗传因子。